Al ingresar a la iglesia observamos que el estilo interior es barroco en su mayoría, lo que significa que cada espacio esta recargado y ocupado por pinturas, decoraciones, tallas o cualquier adorno que se las haya podido ocurrir a los artistas: todo esta cubuierto desde vigas a techos, lo singular es que el artistas mestizo encontró espacio para manifestarse, combinando los elementos europeos (en los que se conjuga un cierto estilo mozárabe con reminiscencias medievales) con sus propias ideas del mundo cristiano.
A ambos lados de la única nave de! templo, se presentan hermosos retablos y lienzos. Las vidas de San Pedro y San Pablo o la Asunción de la Virgen María son algunos de los temas que inspiran el trabajo de pintores como el italiano Bernardo Bitti y el indígena peruano Diego Quispe Titu, ambos artistas que pertenecen a la escuela cusqueña. Lo curioso del asunto es que junto a las típicas y conicidas escenas bíblicas figuran papagayos y animales típicos del Perú.